ขวดน้ำยามีหลายประเภท

ขวดแก้วหรือพลาสติกที่บรรจุน้ำยาสามารถจำแนกได้หลากหลายตามสี รูปร่าง และวัตถุประสงค์
แก้ว พลาสติก; ปลั๊กแก้ว ปลั๊กยาง ปากกว้างปากแคบ สีน้ำตาลใส ปากดิน ปากไม่พื้น และวิธีการจำแนกประเภทอื่น ๆ
ควรเก็บกรดไฮโดรฟลูออริกไว้ในขวดพลาสติก และขวดแก้วมักจะใช้สำหรับน้ำยาอื่นๆ
สารที่เป็นด่าง เช่น โซเดียมไฮดรอกไซด์ และแก้วน้ำ ควรใช้จุกยางแทนจุกแก้ว เบนซิน โทลูอีน อีเทอร์ และตัวทำละลายอินทรีย์อื่นๆ ควรใช้จุกแก้วแทนจุกยาง
ขวดปากกว้างใช้สำหรับใส่รีเอเจนต์ที่เป็นของแข็ง และขวดปากแคบใช้สำหรับเก็บรีเอเจนต์ที่เป็นของเหลว โบรมีนเหลวจะถูกเก็บไว้ในขวดปากแคบ และน้ำจะถูกเติมลงบนพื้นผิวของเหลวเพื่อทำให้เป็น "น้ำปิดผนึก" และปากขวดจะถูกปิดผนึกด้วยขี้ผึ้ง ควรเก็บฟอสฟอรัสขาวในปริมาณเล็กน้อยไว้ในน้ำ
รีเอเจนต์ที่สลายตัวหรือเสื่อมสภาพง่ายเมื่อถูกแสงมักเก็บไว้ในขวดสีน้ำตาล เช่น กรดไนตริก ซิลเวอร์ไนเตรต น้ำคลอรีน เป็นต้น เก็บในที่มืดและเย็น โดยทั่วไปแล้วคนอื่น ๆ จะใช้ขวดที่ไม่มีสี
ขวดที่มีจุกกราวด์ (ด้านในของขวดออกแบบให้มีพื้นผิวเป็นฝ้า) สามารถเก็บซีลไว้ ป้องกันไม่ให้น้ำยาดูดความชื้นและเปลี่ยนความเข้มข้น ขวดที่มีหยดดินเรียกว่าขวดหยด รีเอเจนต์ที่เสื่อมสภาพเนื่องจากการดูดซับก๊าซคาร์บอนไดออกไซด์หรือไอน้ำควรปิดผนึกและจัดเก็บ (เช่น NaOH น้ำปูนใส ผงฟอกขาว น้ำแก้ว Na2O2 เป็นต้น) กรดไฮโดรคลอริกเข้มข้น น้ำแอมโมเนีย ไอโอดีน เบนซิน โทลูอีน อีเธอร์ และสารอินทรีย์จุดเดือดต่ำอื่นๆ จะถูกเก็บไว้ในขวดที่ปิดสนิทด้วยฝาพลาสติกและวางไว้ในที่เย็นและมืด
ในบรรดารีเอเจนต์ที่ออกซิไดซ์และเสื่อมสภาพได้ง่าย สารที่ออกฤทธิ์ เช่น โพแทสเซียม โซเดียม และแคลเซียมจะถูกเก็บไว้ในน้ำมันก๊าด โพแทสเซียมไอโอไดด์ เฟอรัสซัลไฟด์ และโซเดียมซัลเฟตมักจะเก็บเป็นของแข็งแทนสารละลาย ใส่ผงเหล็กหรือตะปูลงไปเล็กน้อย
ห้องปฏิบัติการส่วนใหญ่ในโลกใช้ขวดน้ำยาที่ผลิตโดยบริษัทเยอรมัน เนื่องจากฝาทำจากพลาสติกสีน้ำเงิน หรือที่เรียกว่าขวดน้ำยาฝาสีน้ำเงิน